牙周基础治疗的目的在于消除致病因素，控制炎症，也有人称此阶段为病因治疗。包括自我控制菌斑、正确有效地刷牙、龈上洁治术（洗牙）、龈下刮治术、根面平整术、咬合调整消除咬合性创伤、松动牙齿的牙周夹板固定以及拔除无保留价值的患牙等。
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